乡村卫生一体化管理系统可实现县卫生局——乡镇卫生院（社区卫生服务中心）——卫生室（社区服务站）三J联网。同时实现了新农合患者当场刷卡报销，全县就诊者健康档案信息共享，已经药品的统一采购、定价与管理。

各乡镇医院微机管理员从卫生局L取系统管理员账号后，便可负责区域内卫生室医生系统账户、药品字典以及项目字典的维护工作。

卫生室微机管理员可根据医院分配账户，可进行系统登陆、人员添加、药品盘点、处方划价报销、日结账、月底农合报销等工作。

医院可启动在线药库对下属卫生室进行日常业务往来、医院采购药品入库、医院药品网上出库、卫生室网上入库进行管控。

          村室处方业务：村室医生开方、村室处方查询、医生用药规范。

    村室药品管理：村          室药品录入申请（录入查询、医院审核）、村室库存药品管理（盘点、调价申请）。

         村室业务统计：村室财务汇总、村室工作量统计。

         村室农合门诊直报：农合村室报销、农合报账统计。